◆パイラタウン

・ONBSビル４階で、女の子とおじいさんから「ウソハチを探して欲しい」と頼まれる
・スレッドからアイオポートにいるザックの話を聞く

　◆アイオポート

・パーツショップにいるザックから、スクーター改造の話を聞く
・ザックにカミンコ博士の館にいるルースに会いに行くよう言われる

　◆カミンコ博士の館

・チョビンとバトル
・カミンコ博士の質問に「はい」と答え、メカ・グラードンに乗ったチョビンとバトル
・地下１階の秘密工場でルースに話しかけて、スクーター改造を依頼する

　◆アイオポート

・パーツショップで改造したスクーターを受け取り、北の砂漠へ向かう

　◆リブラ号

・シャドー幹部ゴリガンの会話を聞いた後、戦闘員のスグルとバトル
・乗組員から地下の捜索を依頼される
・地下でウソハチを発見するが、逃げられる
・外に出ると、スナッチ団にスナッチマシンを奪われてしまう
・乗組員に、スナッチ団は北に向かったと教えてもらう

　◆？？？？（シャドーの秘密工場）

・あらくれもののザクスカとバトル
・レンからメール「シャドーの新情報か？」が届く

　◆パイラタウン

・ONBSビル２階のレンから、町外れのスタンドに行くよう頼まれる

　◆町外れのスタンド

・さすらいのミラーボとバトル
・ダニーからシャドーの秘密工場に話を聞き、ダーク・トゲピーのリライブを依頼される
・店から出ようとすると、レンからメール「スナッチ団の潜伏先」が届く
・外でライダーのウィリーとバトル

　◆スナッチ団アジト

・スナッチ団ボスのヘルゴンザとバトル
（マルマインLv.30　コノハナLv.32　ラフレシアLv.30　ナマズンLv.31　エアームドLv.32）
・スナッチマシンを取り返し、「ゴンザのカギ」を手に入れる

　◆シャドーの秘密工場

・あらくれもののザクスカとバトル
・屋上で研究員に、「かいじょレバー」をとってくるように頼まれる
・４階の机の上で「かいじょレバー」を手に入れ、研究員に渡す
・「かいじょレバー」を使ってコントロールマシンの電圧をあげ、秘密工場を破壊する
・シャドー幹部のゴリガンとバトル
（コドラLv.36　トドグラーLv.36　ヤドキングLv.36　リングマLv.36　オコリザルLv.34　スリーパーLv.34）
・モニターにシャドー総帥デスゴルド（メチャリッチ）が映し出され、本拠地がニケルダーク島と判明する
・P★DAにダークポケモンの製造リストをダウンロードする
他のダークポケモン：ザングースLv.28　ガーディLv.28　パラスLv.28　シェルダーLv.28　スピアーLv.30　ピジョンLv.30　バタフリーLv.30　モンジャラLv.30　レアコイルLv.30　モルフォンLv.32　ウツドンLv.32
アーボックLv.33

　◆アイオポート

・パーツショップでルースに話しかけ、メカ・カイオーガでニケルダーク島へ行く

　◆ニケルダーク島

・基地１階でシャドー幹部ラブリナとバトル
（サーナイトLv.36　サクラビスLv.36　ロゼリアLv.37　カモネギLv.36　チルタリスLv.36）
・基地２階ー１、白いブロックを４つ落として道を作る
・最上階でシャドー幹部ワズルとバトル
（メタングLv.42　ヌオーLv.42　ハッサムLv.42　ポワルンLv.42　ソルロックLv.41　スターミーLv.41）
・ドームの前でシャドー幹部アルドスとバトル
（フーディンLv.44　キングドラLv.44　ヘラクロスLv.44　エレブーLv.43　オオスバメLv.43　カビゴンLv.43）
・ドーム内に入り、デスゴルドと話す
・ドームから出て、シャドー幹部ゴリガンとバトル
（ヤドキングLv.42　リングマLv.43　ボスゴドラLv.43　トドゼルガLv.44　ニョロボンLv.42　バリヤードLv.42）
・ゴリガンが現れたエレベーターから下に下がり、ドーム内に向かう
ここまでに登場する他のダークポケモン：ゴルダックLv.33　ヤミラミLv.33　ラッタLv.34　ドードリオLv.34　ガルーラLv.35　ジュペッタLv.37　ブーバーLv.36　カイロスLv.35　マグカルゴLv.38　ギャロップLv.40
エビワラーLv.38　サワムラーLv.38　ベロリンガLv.38　ストライクLv.40　ラッキーLv.39　ダグトリオLv.40
・ドーム１階で、シャドー幹部エルデスとバトル
（テッカニンLv.45　フライゴンLv.45　ライボルトLv.44　ガラガラLv.44　ラプラスLv.44　ボーマンダLv.50）
・ドーム内のエレベーターで上に上がり、ダーク・ルギアLv.50とバトル
（わざ：ダークブラスト　ダークリムーブ　ダークダウン　ダークストーム）
・シャドー総帥デスゴルドとラストバトル
（サンダーLv.50　ファイヤーLv.50　フリーザーLv.50　ケンタロスLv.46　サイドンLv.46　ナッシーLv.46）

　 感動のエンディング！！